1.就在兄弟俩以为自己终于重生的时候，他们被拉回了原点——这样的逃离会更加危险 。
2.就在迈克尔成功将被诬陷为杀人犯的哥哥林肯从福克斯河监狱解救出来后，迈克尔、林肯等几名逃犯成为全国搜捕的目标，并逐渐将剩余的犯人引至巴拿马 。虽然随着逐渐明朗，林肯已经被美国法院宣判无罪，但兄弟俩自由快乐的时间很短，因为迈克尔很快就被“公司”设计出来，送进了索纳监狱 。这个有政*背景的“公司”，也是栽赃陷害林肯入狱的“公司” 。迈克尔很快意识到，他被送到这所监狱的原因是为了让他计划另一次看似困难且几乎不可能的越狱 。这次他想帮助逃跑的人是魏斯勒，一个住在下水道里的非常神秘的囚犯 。迈克尔在巴拿马的恐怖监狱索纳(sona)被错误逮捕，那里没有法律，没有狱警，也没有逃跑的机会 。
【越狱第三季剧情】
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3.索纳监狱不同于美国监狱 。监狱看守和相关部门被一场囚犯暴动所回避 。从那以后，狱警只在离监狱几十米的地方用栅栏围了起来 。在监狱里，囚犯只能自己照顾自己，但现在是囚犯的老板卢西洛真正在内部管理监狱 。
4.自从到了索纳监狱，迈克尔要做的就是避免让犯人老大卢西洛起疑或者得罪他 。与此同时，他还得时刻留意和他一起入狱的三名犯人，以避免越狱计划更有可能破产：叛变的联邦调查局特工马宏也参与了公司的事务 。巴里克是福克斯河监狱的前狱警，他追捕逃犯是为了获得赏金，他自己也不想进监狱 。西奥多“t-bag”是巴格韦尔的一个独臂变态杀人犯 。
5.林肯需要帮助他越狱，因为只有成功越狱，他才能救回儿子lj和迈克尔深爱的女友 。在巴拿马，林肯和福克斯河监狱的另一名逃犯苏克雷遇到了两个美丽的女人：苏珊，公司里一个无情的女人 。魏斯勒的无辜女友索菲亚，没想到危险逼近 。
6.时间非常有限，迈克尔和林肯必须尽快找到并与亲人团聚，摧毁“公司”，执行比较困难的逃生计划 。