1.在明日方舟的游戏视图中，玩家扮演的罗德岛博士由于未知原因失忆 。在少女阿米娅的帮助下，他和许多军官一起抵制激进组织整合运动，探索治*源石病的方法 。
2.序言的情节是阿米亚带领罗德岛的军官进入切尔诺伯格营救医生 。于是，融合运动在车城掀起了一场骚乱，医生命令罗德岛所有的人冲破包围 。比较后军官艾斯死在了房子后面，罗德岛一行人突破了一体化运动的围剿 。
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3.第二章结束后，罗德岛去了龙门这个移动城市，讨论合作事宜，在这里遇到了龙门公安局的陈 。罗德岛发现整合运动已经渗透到龙门，罗德岛为了追踪某关键人物的行踪，以整合运动追击龙门周围狭小的地形 。罗德岛首先找到了关键人物：米砂，他的父亲是切尔诺伯格的重要人物之一，但比较终被整合运动的埋伏驱散，米砂被整合运动劫持 。
4.然后为了打散罗德岛的势力，综合运动的断骨试图伏击秒*医生，但阿米亚及时爆发保护医生，断骨重伤 。米砂终于揭露了 。断骨是米砂的弟弟，年轻时因源石病被带走 。比较终，米砂的家庭被城市切割暴动中的整合运动所摧毁，而米砂自己也成了源石病患者 。第三章末，米砂决定站在整合势力一边，与罗德岛、龙门为敌 。
【明日方舟剧情】5.第四章结尾，融合运动的w引诱罗德岛和龙门保密局进入陷阱 。虽然罗德岛比较终成功逃脱，但浮士德和弑君者早已摧毁了龙门的一道防线，整合运动即将闯入龙门 。